Как и в случае с сериалом «Последняя фантазия», название которого не помешало выпустить уже множество сезонов, думается, что и слово обозначающее конец в названии этого мультфильма, вовсе не означает то, что с героями этого аниме нам предстоит увидеться в последний раз.
Главный персонаж мультфильма поставлен перед фактом, что пока он не посещал Землю, все очень сильно изменилось и выглядит довольно странно. Постаревший отец предлагает ему миссию по управлению тринадцатой Евой. После этого следует ряд катастрофических событий, в результате которых освобожденный двенадцатый Ангел совершает поглощение порученной главному герою Евы и готовит ее к фатальному удару по планете.